Los pigmentos cambian por síntesis, degradación o modificaciones químicas. pueden verse rojas, moradas o azules según pH y otras moléculas de la célula; carotenoides aportan amarillos y naranjas. Durante maduración o después de polinización, hormonas activan genes que alteran esos pigmentos. El cambio puede señalar a polinizadores qué flores aún ofrecen recompensa, como ocurre en algunas lantanas, y reducir visitas inútiles. En otras especies refleja envejecimiento sin una función de señal demostrada. Luz, temperatura y nutrientes también influyen. No suele ser que los pétalos «se pinten» desde afuera, sino que sus células cambian composición u organización.